STR-Polymorphismen in einer historischen Rasse, im Ciktaschaf
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Die Bestandsstruktur der gefährdeten Cikta Schafrasse wurde anhand von neun
Mikrosatelliten-Polymorphismen bewertet. Aus 72 Tieren von drei Herden wurden
Blutproben genommen, um die genetischen Indizes in der ungarischen Population zu
bestimmen. Insgesamt waren die beobachteten und wirksamen Allel-Zahlen im Durchschnitt
5,63 bzw. 3,76. Hohe Werte für die erwartete Heterozygosität (0,65 0,87) zeigten den
Auszucht Status an. Die Diskriminanzanalyse basierend auf den Genotyp-Frequenzen zeigte
eine moderate genetische Diversität unter den Cikta-Herden, da nur drei Loci (OarCP49,
CSSM47 und OarHH41) signifikant Unterscheidung (P <0,05) von den Subpopulationen
hatten. Die geringeren Entfernungen von Mahalanobis zu Gruppen-Zentroiden bestätigten
ebenfalls, dass die Rasse durch die drei Herden fast gleich stark vertreten ist. Das moderate
Niveau der Diversität zwischen den Herden wurde auf die langfristigen Auswirkungen eines
Bestandsengpasses aus den 70er Jahren zurückgeführt. Für ...die Erhaltung seltener Allele und
Diversität bei Cikta-Schafen sind fortlaufende Informationen von Mikrosatelliten erforderlich
The population structure of the endangered Cikta sheep breed was evaluated by means of nine
microsatellite polymorphisms. Seventy-two individuals from three flocks were sampled to
determine genetic indices in the Hungarian population. Overall, average observed and
effective allele numbers were 5.63 and 3.76, respectively. High values of expected
heterozygosity (0.65-0.87) indicated outbred status. Discriminant analysis based on genotype
frequencies revealed moderate genetic diversity among Cikta flocks, since only three loci
(OarCP49, CSSM47 and OarHH41) contributed significantly (P<0.05) to differences between
subpopulations. Low squared Mahalanobis distances from group centroids also confirmed that
the breed is almost equally represented by the three flocks. Moderate level of diversity
between flocks was attributed to the long-term effects of a population bottleneck dating back
to the 1970s. Continuous microsatellite information is required for the preservation of rare
all...eles and diversity in Cikta sheep.
Кључне речи:
ungarischer Ciktaschaf / Mikrosatelliten-Polymorphismen / relativer Shannonsche Index / Mahalanobis-DistanzИзвор:
30th Annual Meeting of DAGENE, Slovakia, 29th may-1st June 2019, 2019, 4, 65-71Издавач:
- DAGENE - International association for the conservation of animal breeds in the Danube region
Напомена:
- Proceedings
Колекције
Институција/група
Fakultet veterinarske medicineTY - CONF AU - Kovács, Endre AU - Tempfli, Kárloy AU - Becskei, Zsolt AU - Bali Papp, Agnes AU - Gáspárdy, András PY - 2019 UR - https://vet-erinar.vet.bg.ac.rs/handle/123456789/2780 AB - Die Bestandsstruktur der gefährdeten Cikta Schafrasse wurde anhand von neun Mikrosatelliten-Polymorphismen bewertet. Aus 72 Tieren von drei Herden wurden Blutproben genommen, um die genetischen Indizes in der ungarischen Population zu bestimmen. Insgesamt waren die beobachteten und wirksamen Allel-Zahlen im Durchschnitt 5,63 bzw. 3,76. Hohe Werte für die erwartete Heterozygosität (0,65 0,87) zeigten den Auszucht Status an. Die Diskriminanzanalyse basierend auf den Genotyp-Frequenzen zeigte eine moderate genetische Diversität unter den Cikta-Herden, da nur drei Loci (OarCP49, CSSM47 und OarHH41) signifikant Unterscheidung (P <0,05) von den Subpopulationen hatten. Die geringeren Entfernungen von Mahalanobis zu Gruppen-Zentroiden bestätigten ebenfalls, dass die Rasse durch die drei Herden fast gleich stark vertreten ist. Das moderate Niveau der Diversität zwischen den Herden wurde auf die langfristigen Auswirkungen eines Bestandsengpasses aus den 70er Jahren zurückgeführt. Für die Erhaltung seltener Allele und Diversität bei Cikta-Schafen sind fortlaufende Informationen von Mikrosatelliten erforderlich AB - The population structure of the endangered Cikta sheep breed was evaluated by means of nine microsatellite polymorphisms. Seventy-two individuals from three flocks were sampled to determine genetic indices in the Hungarian population. Overall, average observed and effective allele numbers were 5.63 and 3.76, respectively. High values of expected heterozygosity (0.65-0.87) indicated outbred status. Discriminant analysis based on genotype frequencies revealed moderate genetic diversity among Cikta flocks, since only three loci (OarCP49, CSSM47 and OarHH41) contributed significantly (P<0.05) to differences between subpopulations. Low squared Mahalanobis distances from group centroids also confirmed that the breed is almost equally represented by the three flocks. Moderate level of diversity between flocks was attributed to the long-term effects of a population bottleneck dating back to the 1970s. Continuous microsatellite information is required for the preservation of rare alleles and diversity in Cikta sheep. PB - DAGENE - International association for the conservation of animal breeds in the Danube region C3 - 30th Annual Meeting of DAGENE, Slovakia, 29th may-1st June 2019 T1 - STR-Polymorphismen in einer historischen Rasse, im Ciktaschaf VL - 4 SP - 65 EP - 71 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_2780 ER -
@conference{ author = "Kovács, Endre and Tempfli, Kárloy and Becskei, Zsolt and Bali Papp, Agnes and Gáspárdy, András", year = "2019", abstract = "Die Bestandsstruktur der gefährdeten Cikta Schafrasse wurde anhand von neun Mikrosatelliten-Polymorphismen bewertet. Aus 72 Tieren von drei Herden wurden Blutproben genommen, um die genetischen Indizes in der ungarischen Population zu bestimmen. Insgesamt waren die beobachteten und wirksamen Allel-Zahlen im Durchschnitt 5,63 bzw. 3,76. Hohe Werte für die erwartete Heterozygosität (0,65 0,87) zeigten den Auszucht Status an. Die Diskriminanzanalyse basierend auf den Genotyp-Frequenzen zeigte eine moderate genetische Diversität unter den Cikta-Herden, da nur drei Loci (OarCP49, CSSM47 und OarHH41) signifikant Unterscheidung (P <0,05) von den Subpopulationen hatten. Die geringeren Entfernungen von Mahalanobis zu Gruppen-Zentroiden bestätigten ebenfalls, dass die Rasse durch die drei Herden fast gleich stark vertreten ist. Das moderate Niveau der Diversität zwischen den Herden wurde auf die langfristigen Auswirkungen eines Bestandsengpasses aus den 70er Jahren zurückgeführt. Für die Erhaltung seltener Allele und Diversität bei Cikta-Schafen sind fortlaufende Informationen von Mikrosatelliten erforderlich, The population structure of the endangered Cikta sheep breed was evaluated by means of nine microsatellite polymorphisms. Seventy-two individuals from three flocks were sampled to determine genetic indices in the Hungarian population. Overall, average observed and effective allele numbers were 5.63 and 3.76, respectively. High values of expected heterozygosity (0.65-0.87) indicated outbred status. Discriminant analysis based on genotype frequencies revealed moderate genetic diversity among Cikta flocks, since only three loci (OarCP49, CSSM47 and OarHH41) contributed significantly (P<0.05) to differences between subpopulations. Low squared Mahalanobis distances from group centroids also confirmed that the breed is almost equally represented by the three flocks. Moderate level of diversity between flocks was attributed to the long-term effects of a population bottleneck dating back to the 1970s. Continuous microsatellite information is required for the preservation of rare alleles and diversity in Cikta sheep.", publisher = "DAGENE - International association for the conservation of animal breeds in the Danube region", journal = "30th Annual Meeting of DAGENE, Slovakia, 29th may-1st June 2019", title = "STR-Polymorphismen in einer historischen Rasse, im Ciktaschaf", volume = "4", pages = "65-71", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_2780" }
Kovács, E., Tempfli, K., Becskei, Z., Bali Papp, A.,& Gáspárdy, A.. (2019). STR-Polymorphismen in einer historischen Rasse, im Ciktaschaf. in 30th Annual Meeting of DAGENE, Slovakia, 29th may-1st June 2019 DAGENE - International association for the conservation of animal breeds in the Danube region., 4, 65-71. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_2780
Kovács E, Tempfli K, Becskei Z, Bali Papp A, Gáspárdy A. STR-Polymorphismen in einer historischen Rasse, im Ciktaschaf. in 30th Annual Meeting of DAGENE, Slovakia, 29th may-1st June 2019. 2019;4:65-71. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_2780 .
Kovács, Endre, Tempfli, Kárloy, Becskei, Zsolt, Bali Papp, Agnes, Gáspárdy, András, "STR-Polymorphismen in einer historischen Rasse, im Ciktaschaf" in 30th Annual Meeting of DAGENE, Slovakia, 29th may-1st June 2019, 4 (2019):65-71, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_2780 .