Izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini
Isolation, identification and molecular characterization of causative agent of bovine tuberculosis in Vojvodina region
Докторска теза (Објављена верзија)
Метаподаци
Приказ свих података о документуАпстракт
Cilј istraživanja bio je da se izvrši izolacija, identifikacija i molekularna
karakterizacija, uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini, kao i ispitivanje osetlјivosti
izolovanih sojeva na odabrane antituberkulozne antibiotike koji se koriste za terapiju
tuberkuloze lјudi u našoj zemlјi. Pored toga cilj istraživanja bilo je i uporedno
ispitivanje osetlјivosti i specifičnosti γ-IFN testa u dijagnostici tuberkuloze sa klasičnim
mikrobiološkim metodama izolacije i identifikacije uzročnika. Konačno, na osnovu
ispitivanja raširenosti, incidencije i prevalencije oboljenja u zapatima cilj je bila i izrada
aktuelne epizootiološke karte raširenosti tuberkuloze goveda u Vojvodini.
Za izolaciju bakterija MTB-kompleksa korišćeni su uzorci tkiva (pluća i limfni
čvorovi) 49 goveda koja su prilikom izvođenja komparativnog tuberkulinskog ili γ-IFN
testa imala pozitivnu reakciju. Kod 40 od ovih grla prilikom patomorfološkog pregleda
na liniji klanja, bile su ustanovljene promene koje mogu uk...azivati na tuberkulozu.
Bakterije MTB-kompleksa uspešno su izolovane iz uzoraka tkiva 19 goveda, dok je
nalaz acidorezistentnih bakterija ustanovljen direktnom mikroskopijom u uzorcima
limfnih čvorova kod još 3 grla, ali izolacija nije uspela usled kontaminacije. Na osnovu
klasičnih bakterioloških metoda, izgleda i rasta kolonija, kao i primenom standardnih
biohemijskih testova identifikacije, svi izolati su tipizovani u vrstu M. bovis.
Na osetljivost prema izoniazidu, streptomicinu, etambutolu i rifampicinu,
antituberkuloticima prve linije koji se u našoj zemlji koriste za lečenje ljudi obolelih od
tuberkuloze, standardnom metodom proporcija, ispitano je 5 reprezentativnih izolata.
Izolati su bili poreklom od goveda iz pet različitih zapata lociranih u naseljima na
teritoriji 5 opština, od kojih su 4 u Južnobačkom i 1 u Sremskom okrugu. Ustanovljena
je osetljivost izolata na sve ispitivane antituberkulotike, odnosno ni u jednom slučaju
nije utvrđena pojava rezistencije.
Metodom PCR spoligotipizacije u cilju molekularne karakterizacije i
genotipizacije bakterija M.tuberculosis kompleksa ispitano je 18 izolata mikobakterija
kod kojih je proces ekstrakcije DNK bio uspešan. Rezultati molekularne karakterizacije
odnosno spoligotipizacije izolovanih mikobakterija pokazuju odsustvo spejsera 1 i niza
spejsera od 3 sve do 16, kao i spejsera 28 što je karakteristično za Mycobacterium
caprae. Odsustvo spejsera 28 i niza spejsera od 39 do 43, kod svih izolata ukazuje na
pripadnost istom klasteru. Automatskom analizom binarnog koda dobijenih izolata u
dve najveće baze podataka ustanovljeno je da se radi o spoligotipu SB 0418 odnosno ST
647, koji po raširenosti predstavlja dominantni klaster Mycobacterium caprae u srednje
evropskim državama.
Uporedno ispitivanje komparativnog tuberkulinskog testa i in vitro γ-IFN testa,
izvršeno je na 71 grlu goveda iz 25 zapata lociranih u Južnobačkom i Sremskom okrugu
kod kojih je prilikom izvođenja monotesta ustanovljena pozitivna ili sumnjiva reakcija.
Rezultati ispitivanja su na osnovu izračunate Kappa-statističke vrednosti pokazali
srednju saglasnost dva testa, dok je ispitivanje osetljivosti γ-IFN testa u odnosu na post
mortem potvrđene slučajeve tuberkuloze, iznosilo 90%.
U radu je prikazana i epizootiološka situacija tuberkuloze goveda u Vojvodini za
period od prethodnih šest godina. Naročito je detaljno analizirana incidencija i
prevalencija oboljenja u delovima Južnobačkog okruga, u kojima su ustanovljena žarišta
sa endemski prisutnom tuberkulozom goveda. Na osnovu rezultata istraživanja
napravljena je aktuelna epizootiološka karta tuberkuloze goveda u Vojvodini.
Кључне речи:
tuberkuloza goveda / izolacija / MTB-kompleks / spoligotipizacija / antibiotska osetljivost / γ-IFN test / epizootiološka kartaИзвор:
2016, 2016Издавач:
- Univerzitet u Beogradu, Fakultet veterinarske medicine
Колекције
Институција/група
Fakultet veterinarske medicineTY - THES AU - Pušić, Ivan PY - 2016 UR - https://vet-erinar.vet.bg.ac.rs/handle/123456789/3376 AB - Cilј istraživanja bio je da se izvrši izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija, uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini, kao i ispitivanje osetlјivosti izolovanih sojeva na odabrane antituberkulozne antibiotike koji se koriste za terapiju tuberkuloze lјudi u našoj zemlјi. Pored toga cilj istraživanja bilo je i uporedno ispitivanje osetlјivosti i specifičnosti γ-IFN testa u dijagnostici tuberkuloze sa klasičnim mikrobiološkim metodama izolacije i identifikacije uzročnika. Konačno, na osnovu ispitivanja raširenosti, incidencije i prevalencije oboljenja u zapatima cilj je bila i izrada aktuelne epizootiološke karte raširenosti tuberkuloze goveda u Vojvodini. Za izolaciju bakterija MTB-kompleksa korišćeni su uzorci tkiva (pluća i limfni čvorovi) 49 goveda koja su prilikom izvođenja komparativnog tuberkulinskog ili γ-IFN testa imala pozitivnu reakciju. Kod 40 od ovih grla prilikom patomorfološkog pregleda na liniji klanja, bile su ustanovljene promene koje mogu ukazivati na tuberkulozu. Bakterije MTB-kompleksa uspešno su izolovane iz uzoraka tkiva 19 goveda, dok je nalaz acidorezistentnih bakterija ustanovljen direktnom mikroskopijom u uzorcima limfnih čvorova kod još 3 grla, ali izolacija nije uspela usled kontaminacije. Na osnovu klasičnih bakterioloških metoda, izgleda i rasta kolonija, kao i primenom standardnih biohemijskih testova identifikacije, svi izolati su tipizovani u vrstu M. bovis. Na osetljivost prema izoniazidu, streptomicinu, etambutolu i rifampicinu, antituberkuloticima prve linije koji se u našoj zemlji koriste za lečenje ljudi obolelih od tuberkuloze, standardnom metodom proporcija, ispitano je 5 reprezentativnih izolata. Izolati su bili poreklom od goveda iz pet različitih zapata lociranih u naseljima na teritoriji 5 opština, od kojih su 4 u Južnobačkom i 1 u Sremskom okrugu. Ustanovljena je osetljivost izolata na sve ispitivane antituberkulotike, odnosno ni u jednom slučaju nije utvrđena pojava rezistencije. Metodom PCR spoligotipizacije u cilju molekularne karakterizacije i genotipizacije bakterija M.tuberculosis kompleksa ispitano je 18 izolata mikobakterija kod kojih je proces ekstrakcije DNK bio uspešan. Rezultati molekularne karakterizacije odnosno spoligotipizacije izolovanih mikobakterija pokazuju odsustvo spejsera 1 i niza spejsera od 3 sve do 16, kao i spejsera 28 što je karakteristično za Mycobacterium caprae. Odsustvo spejsera 28 i niza spejsera od 39 do 43, kod svih izolata ukazuje na pripadnost istom klasteru. Automatskom analizom binarnog koda dobijenih izolata u dve najveće baze podataka ustanovljeno je da se radi o spoligotipu SB 0418 odnosno ST 647, koji po raširenosti predstavlja dominantni klaster Mycobacterium caprae u srednje evropskim državama. Uporedno ispitivanje komparativnog tuberkulinskog testa i in vitro γ-IFN testa, izvršeno je na 71 grlu goveda iz 25 zapata lociranih u Južnobačkom i Sremskom okrugu kod kojih je prilikom izvođenja monotesta ustanovljena pozitivna ili sumnjiva reakcija. Rezultati ispitivanja su na osnovu izračunate Kappa-statističke vrednosti pokazali srednju saglasnost dva testa, dok je ispitivanje osetljivosti γ-IFN testa u odnosu na post mortem potvrđene slučajeve tuberkuloze, iznosilo 90%. U radu je prikazana i epizootiološka situacija tuberkuloze goveda u Vojvodini za period od prethodnih šest godina. Naročito je detaljno analizirana incidencija i prevalencija oboljenja u delovima Južnobačkog okruga, u kojima su ustanovljena žarišta sa endemski prisutnom tuberkulozom goveda. Na osnovu rezultata istraživanja napravljena je aktuelna epizootiološka karta tuberkuloze goveda u Vojvodini. PB - Univerzitet u Beogradu, Fakultet veterinarske medicine T2 - 2016 T1 - Izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini T1 - Isolation, identification and molecular characterization of causative agent of bovine tuberculosis in Vojvodina region UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_3376 ER -
@phdthesis{ author = "Pušić, Ivan", year = "2016", abstract = "Cilј istraživanja bio je da se izvrši izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija, uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini, kao i ispitivanje osetlјivosti izolovanih sojeva na odabrane antituberkulozne antibiotike koji se koriste za terapiju tuberkuloze lјudi u našoj zemlјi. Pored toga cilj istraživanja bilo je i uporedno ispitivanje osetlјivosti i specifičnosti γ-IFN testa u dijagnostici tuberkuloze sa klasičnim mikrobiološkim metodama izolacije i identifikacije uzročnika. Konačno, na osnovu ispitivanja raširenosti, incidencije i prevalencije oboljenja u zapatima cilj je bila i izrada aktuelne epizootiološke karte raširenosti tuberkuloze goveda u Vojvodini. Za izolaciju bakterija MTB-kompleksa korišćeni su uzorci tkiva (pluća i limfni čvorovi) 49 goveda koja su prilikom izvođenja komparativnog tuberkulinskog ili γ-IFN testa imala pozitivnu reakciju. Kod 40 od ovih grla prilikom patomorfološkog pregleda na liniji klanja, bile su ustanovljene promene koje mogu ukazivati na tuberkulozu. Bakterije MTB-kompleksa uspešno su izolovane iz uzoraka tkiva 19 goveda, dok je nalaz acidorezistentnih bakterija ustanovljen direktnom mikroskopijom u uzorcima limfnih čvorova kod još 3 grla, ali izolacija nije uspela usled kontaminacije. Na osnovu klasičnih bakterioloških metoda, izgleda i rasta kolonija, kao i primenom standardnih biohemijskih testova identifikacije, svi izolati su tipizovani u vrstu M. bovis. Na osetljivost prema izoniazidu, streptomicinu, etambutolu i rifampicinu, antituberkuloticima prve linije koji se u našoj zemlji koriste za lečenje ljudi obolelih od tuberkuloze, standardnom metodom proporcija, ispitano je 5 reprezentativnih izolata. Izolati su bili poreklom od goveda iz pet različitih zapata lociranih u naseljima na teritoriji 5 opština, od kojih su 4 u Južnobačkom i 1 u Sremskom okrugu. Ustanovljena je osetljivost izolata na sve ispitivane antituberkulotike, odnosno ni u jednom slučaju nije utvrđena pojava rezistencije. Metodom PCR spoligotipizacije u cilju molekularne karakterizacije i genotipizacije bakterija M.tuberculosis kompleksa ispitano je 18 izolata mikobakterija kod kojih je proces ekstrakcije DNK bio uspešan. Rezultati molekularne karakterizacije odnosno spoligotipizacije izolovanih mikobakterija pokazuju odsustvo spejsera 1 i niza spejsera od 3 sve do 16, kao i spejsera 28 što je karakteristično za Mycobacterium caprae. Odsustvo spejsera 28 i niza spejsera od 39 do 43, kod svih izolata ukazuje na pripadnost istom klasteru. Automatskom analizom binarnog koda dobijenih izolata u dve najveće baze podataka ustanovljeno je da se radi o spoligotipu SB 0418 odnosno ST 647, koji po raširenosti predstavlja dominantni klaster Mycobacterium caprae u srednje evropskim državama. Uporedno ispitivanje komparativnog tuberkulinskog testa i in vitro γ-IFN testa, izvršeno je na 71 grlu goveda iz 25 zapata lociranih u Južnobačkom i Sremskom okrugu kod kojih je prilikom izvođenja monotesta ustanovljena pozitivna ili sumnjiva reakcija. Rezultati ispitivanja su na osnovu izračunate Kappa-statističke vrednosti pokazali srednju saglasnost dva testa, dok je ispitivanje osetljivosti γ-IFN testa u odnosu na post mortem potvrđene slučajeve tuberkuloze, iznosilo 90%. U radu je prikazana i epizootiološka situacija tuberkuloze goveda u Vojvodini za period od prethodnih šest godina. Naročito je detaljno analizirana incidencija i prevalencija oboljenja u delovima Južnobačkog okruga, u kojima su ustanovljena žarišta sa endemski prisutnom tuberkulozom goveda. Na osnovu rezultata istraživanja napravljena je aktuelna epizootiološka karta tuberkuloze goveda u Vojvodini.", publisher = "Univerzitet u Beogradu, Fakultet veterinarske medicine", journal = "2016", title = "Izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini, Isolation, identification and molecular characterization of causative agent of bovine tuberculosis in Vojvodina region", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_3376" }
Pušić, I.. (2016). Izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini. in 2016 Univerzitet u Beogradu, Fakultet veterinarske medicine.. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_3376
Pušić I. Izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini. in 2016. 2016;. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_3376 .
Pušić, Ivan, "Izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini" in 2016 (2016), https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_3376 .