Izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini
Isolation, identification and molecular characterization of causative agent of bovine tuberculosis in Vojvodina region
Doctoral thesis (Published version)
Metadata
Show full item recordAbstract
Cilј istraživanja bio je da se izvrši izolacija, identifikacija i molekularna
karakterizacija, uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini, kao i ispitivanje osetlјivosti
izolovanih sojeva na odabrane antituberkulozne antibiotike koji se koriste za terapiju
tuberkuloze lјudi u našoj zemlјi. Pored toga cilj istraživanja bilo je i uporedno
ispitivanje osetlјivosti i specifičnosti γ-IFN testa u dijagnostici tuberkuloze sa klasičnim
mikrobiološkim metodama izolacije i identifikacije uzročnika. Konačno, na osnovu
ispitivanja raširenosti, incidencije i prevalencije oboljenja u zapatima cilj je bila i izrada
aktuelne epizootiološke karte raširenosti tuberkuloze goveda u Vojvodini.
Za izolaciju bakterija MTB-kompleksa korišćeni su uzorci tkiva (pluća i limfni
čvorovi) 49 goveda koja su prilikom izvođenja komparativnog tuberkulinskog ili γ-IFN
testa imala pozitivnu reakciju. Kod 40 od ovih grla prilikom patomorfološkog pregleda
na liniji klanja, bile su ustanovljene promene koje mogu uk...azivati na tuberkulozu.
Bakterije MTB-kompleksa uspešno su izolovane iz uzoraka tkiva 19 goveda, dok je
nalaz acidorezistentnih bakterija ustanovljen direktnom mikroskopijom u uzorcima
limfnih čvorova kod još 3 grla, ali izolacija nije uspela usled kontaminacije. Na osnovu
klasičnih bakterioloških metoda, izgleda i rasta kolonija, kao i primenom standardnih
biohemijskih testova identifikacije, svi izolati su tipizovani u vrstu M. bovis.
Na osetljivost prema izoniazidu, streptomicinu, etambutolu i rifampicinu,
antituberkuloticima prve linije koji se u našoj zemlji koriste za lečenje ljudi obolelih od
tuberkuloze, standardnom metodom proporcija, ispitano je 5 reprezentativnih izolata.
Izolati su bili poreklom od goveda iz pet različitih zapata lociranih u naseljima na
teritoriji 5 opština, od kojih su 4 u Južnobačkom i 1 u Sremskom okrugu. Ustanovljena
je osetljivost izolata na sve ispitivane antituberkulotike, odnosno ni u jednom slučaju
nije utvrđena pojava rezistencije.
Metodom PCR spoligotipizacije u cilju molekularne karakterizacije i
genotipizacije bakterija M.tuberculosis kompleksa ispitano je 18 izolata mikobakterija
kod kojih je proces ekstrakcije DNK bio uspešan. Rezultati molekularne karakterizacije
odnosno spoligotipizacije izolovanih mikobakterija pokazuju odsustvo spejsera 1 i niza
spejsera od 3 sve do 16, kao i spejsera 28 što je karakteristično za Mycobacterium
caprae. Odsustvo spejsera 28 i niza spejsera od 39 do 43, kod svih izolata ukazuje na
pripadnost istom klasteru. Automatskom analizom binarnog koda dobijenih izolata u
dve najveće baze podataka ustanovljeno je da se radi o spoligotipu SB 0418 odnosno ST
647, koji po raširenosti predstavlja dominantni klaster Mycobacterium caprae u srednje
evropskim državama.
Uporedno ispitivanje komparativnog tuberkulinskog testa i in vitro γ-IFN testa,
izvršeno je na 71 grlu goveda iz 25 zapata lociranih u Južnobačkom i Sremskom okrugu
kod kojih je prilikom izvođenja monotesta ustanovljena pozitivna ili sumnjiva reakcija.
Rezultati ispitivanja su na osnovu izračunate Kappa-statističke vrednosti pokazali
srednju saglasnost dva testa, dok je ispitivanje osetljivosti γ-IFN testa u odnosu na post
mortem potvrđene slučajeve tuberkuloze, iznosilo 90%.
U radu je prikazana i epizootiološka situacija tuberkuloze goveda u Vojvodini za
period od prethodnih šest godina. Naročito je detaljno analizirana incidencija i
prevalencija oboljenja u delovima Južnobačkog okruga, u kojima su ustanovljena žarišta
sa endemski prisutnom tuberkulozom goveda. Na osnovu rezultata istraživanja
napravljena je aktuelna epizootiološka karta tuberkuloze goveda u Vojvodini.
Keywords:
tuberkuloza goveda / izolacija / MTB-kompleks / spoligotipizacija / antibiotska osetljivost / γ-IFN test / epizootiološka kartaSource:
2016, 2016Publisher:
- Univerzitet u Beogradu, Fakultet veterinarske medicine
Collections
Institution/Community
Fakultet veterinarske medicineTY - THES AU - Pušić, Ivan PY - 2016 UR - https://vet-erinar.vet.bg.ac.rs/handle/123456789/3376 AB - Cilј istraživanja bio je da se izvrši izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija, uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini, kao i ispitivanje osetlјivosti izolovanih sojeva na odabrane antituberkulozne antibiotike koji se koriste za terapiju tuberkuloze lјudi u našoj zemlјi. Pored toga cilj istraživanja bilo je i uporedno ispitivanje osetlјivosti i specifičnosti γ-IFN testa u dijagnostici tuberkuloze sa klasičnim mikrobiološkim metodama izolacije i identifikacije uzročnika. Konačno, na osnovu ispitivanja raširenosti, incidencije i prevalencije oboljenja u zapatima cilj je bila i izrada aktuelne epizootiološke karte raširenosti tuberkuloze goveda u Vojvodini. Za izolaciju bakterija MTB-kompleksa korišćeni su uzorci tkiva (pluća i limfni čvorovi) 49 goveda koja su prilikom izvođenja komparativnog tuberkulinskog ili γ-IFN testa imala pozitivnu reakciju. Kod 40 od ovih grla prilikom patomorfološkog pregleda na liniji klanja, bile su ustanovljene promene koje mogu ukazivati na tuberkulozu. Bakterije MTB-kompleksa uspešno su izolovane iz uzoraka tkiva 19 goveda, dok je nalaz acidorezistentnih bakterija ustanovljen direktnom mikroskopijom u uzorcima limfnih čvorova kod još 3 grla, ali izolacija nije uspela usled kontaminacije. Na osnovu klasičnih bakterioloških metoda, izgleda i rasta kolonija, kao i primenom standardnih biohemijskih testova identifikacije, svi izolati su tipizovani u vrstu M. bovis. Na osetljivost prema izoniazidu, streptomicinu, etambutolu i rifampicinu, antituberkuloticima prve linije koji se u našoj zemlji koriste za lečenje ljudi obolelih od tuberkuloze, standardnom metodom proporcija, ispitano je 5 reprezentativnih izolata. Izolati su bili poreklom od goveda iz pet različitih zapata lociranih u naseljima na teritoriji 5 opština, od kojih su 4 u Južnobačkom i 1 u Sremskom okrugu. Ustanovljena je osetljivost izolata na sve ispitivane antituberkulotike, odnosno ni u jednom slučaju nije utvrđena pojava rezistencije. Metodom PCR spoligotipizacije u cilju molekularne karakterizacije i genotipizacije bakterija M.tuberculosis kompleksa ispitano je 18 izolata mikobakterija kod kojih je proces ekstrakcije DNK bio uspešan. Rezultati molekularne karakterizacije odnosno spoligotipizacije izolovanih mikobakterija pokazuju odsustvo spejsera 1 i niza spejsera od 3 sve do 16, kao i spejsera 28 što je karakteristično za Mycobacterium caprae. Odsustvo spejsera 28 i niza spejsera od 39 do 43, kod svih izolata ukazuje na pripadnost istom klasteru. Automatskom analizom binarnog koda dobijenih izolata u dve najveće baze podataka ustanovljeno je da se radi o spoligotipu SB 0418 odnosno ST 647, koji po raširenosti predstavlja dominantni klaster Mycobacterium caprae u srednje evropskim državama. Uporedno ispitivanje komparativnog tuberkulinskog testa i in vitro γ-IFN testa, izvršeno je na 71 grlu goveda iz 25 zapata lociranih u Južnobačkom i Sremskom okrugu kod kojih je prilikom izvođenja monotesta ustanovljena pozitivna ili sumnjiva reakcija. Rezultati ispitivanja su na osnovu izračunate Kappa-statističke vrednosti pokazali srednju saglasnost dva testa, dok je ispitivanje osetljivosti γ-IFN testa u odnosu na post mortem potvrđene slučajeve tuberkuloze, iznosilo 90%. U radu je prikazana i epizootiološka situacija tuberkuloze goveda u Vojvodini za period od prethodnih šest godina. Naročito je detaljno analizirana incidencija i prevalencija oboljenja u delovima Južnobačkog okruga, u kojima su ustanovljena žarišta sa endemski prisutnom tuberkulozom goveda. Na osnovu rezultata istraživanja napravljena je aktuelna epizootiološka karta tuberkuloze goveda u Vojvodini. PB - Univerzitet u Beogradu, Fakultet veterinarske medicine T2 - 2016 T1 - Izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini T1 - Isolation, identification and molecular characterization of causative agent of bovine tuberculosis in Vojvodina region UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_3376 ER -
@phdthesis{ author = "Pušić, Ivan", year = "2016", abstract = "Cilј istraživanja bio je da se izvrši izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija, uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini, kao i ispitivanje osetlјivosti izolovanih sojeva na odabrane antituberkulozne antibiotike koji se koriste za terapiju tuberkuloze lјudi u našoj zemlјi. Pored toga cilj istraživanja bilo je i uporedno ispitivanje osetlјivosti i specifičnosti γ-IFN testa u dijagnostici tuberkuloze sa klasičnim mikrobiološkim metodama izolacije i identifikacije uzročnika. Konačno, na osnovu ispitivanja raširenosti, incidencije i prevalencije oboljenja u zapatima cilj je bila i izrada aktuelne epizootiološke karte raširenosti tuberkuloze goveda u Vojvodini. Za izolaciju bakterija MTB-kompleksa korišćeni su uzorci tkiva (pluća i limfni čvorovi) 49 goveda koja su prilikom izvođenja komparativnog tuberkulinskog ili γ-IFN testa imala pozitivnu reakciju. Kod 40 od ovih grla prilikom patomorfološkog pregleda na liniji klanja, bile su ustanovljene promene koje mogu ukazivati na tuberkulozu. Bakterije MTB-kompleksa uspešno su izolovane iz uzoraka tkiva 19 goveda, dok je nalaz acidorezistentnih bakterija ustanovljen direktnom mikroskopijom u uzorcima limfnih čvorova kod još 3 grla, ali izolacija nije uspela usled kontaminacije. Na osnovu klasičnih bakterioloških metoda, izgleda i rasta kolonija, kao i primenom standardnih biohemijskih testova identifikacije, svi izolati su tipizovani u vrstu M. bovis. Na osetljivost prema izoniazidu, streptomicinu, etambutolu i rifampicinu, antituberkuloticima prve linije koji se u našoj zemlji koriste za lečenje ljudi obolelih od tuberkuloze, standardnom metodom proporcija, ispitano je 5 reprezentativnih izolata. Izolati su bili poreklom od goveda iz pet različitih zapata lociranih u naseljima na teritoriji 5 opština, od kojih su 4 u Južnobačkom i 1 u Sremskom okrugu. Ustanovljena je osetljivost izolata na sve ispitivane antituberkulotike, odnosno ni u jednom slučaju nije utvrđena pojava rezistencije. Metodom PCR spoligotipizacije u cilju molekularne karakterizacije i genotipizacije bakterija M.tuberculosis kompleksa ispitano je 18 izolata mikobakterija kod kojih je proces ekstrakcije DNK bio uspešan. Rezultati molekularne karakterizacije odnosno spoligotipizacije izolovanih mikobakterija pokazuju odsustvo spejsera 1 i niza spejsera od 3 sve do 16, kao i spejsera 28 što je karakteristično za Mycobacterium caprae. Odsustvo spejsera 28 i niza spejsera od 39 do 43, kod svih izolata ukazuje na pripadnost istom klasteru. Automatskom analizom binarnog koda dobijenih izolata u dve najveće baze podataka ustanovljeno je da se radi o spoligotipu SB 0418 odnosno ST 647, koji po raširenosti predstavlja dominantni klaster Mycobacterium caprae u srednje evropskim državama. Uporedno ispitivanje komparativnog tuberkulinskog testa i in vitro γ-IFN testa, izvršeno je na 71 grlu goveda iz 25 zapata lociranih u Južnobačkom i Sremskom okrugu kod kojih je prilikom izvođenja monotesta ustanovljena pozitivna ili sumnjiva reakcija. Rezultati ispitivanja su na osnovu izračunate Kappa-statističke vrednosti pokazali srednju saglasnost dva testa, dok je ispitivanje osetljivosti γ-IFN testa u odnosu na post mortem potvrđene slučajeve tuberkuloze, iznosilo 90%. U radu je prikazana i epizootiološka situacija tuberkuloze goveda u Vojvodini za period od prethodnih šest godina. Naročito je detaljno analizirana incidencija i prevalencija oboljenja u delovima Južnobačkog okruga, u kojima su ustanovljena žarišta sa endemski prisutnom tuberkulozom goveda. Na osnovu rezultata istraživanja napravljena je aktuelna epizootiološka karta tuberkuloze goveda u Vojvodini.", publisher = "Univerzitet u Beogradu, Fakultet veterinarske medicine", journal = "2016", title = "Izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini, Isolation, identification and molecular characterization of causative agent of bovine tuberculosis in Vojvodina region", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_3376" }
Pušić, I.. (2016). Izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini. in 2016 Univerzitet u Beogradu, Fakultet veterinarske medicine.. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_3376
Pušić I. Izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini. in 2016. 2016;. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_3376 .
Pušić, Ivan, "Izolacija, identifikacija i molekularna karakterizacija uzročnika tuberkuloze goveda u Vojvodini" in 2016 (2016), https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_3376 .