Detection and genotyping of classical swine fever virus isolates in Serbia
Detekcija i genotipizacija izolata virusa klasične kuge svinja u Srbiji
2013
Autori
Milićević, VesnaRadojičić, Sonja
Valčić, Miroslav
Ivović, V.
Maksimović-Zorić, Jelena
Radosavljević, Vladimir
Članak u časopisu (Objavljena verzija)
Metapodaci
Prikaz svih podataka o dokumentuApstrakt
Classical swine fever (CSF) is a highly contagious disease of pigs leading to significant economic losses worldwide. Classical swine fever virus can be classified into three genogroups, each consisting of three or four subgroups. However, there is a lack of knowledge on the genotypes of CSFV isolates in Republic of Serbia. This study, based on the sequences analysis of partial E2 gene and 5' non coding region (NCR) of 15 CSFV isolated during 2006-2008 from domestic pigs, revealed that all were clustered into genetic group 2.3. Additionally, we showed that the two most often used real time RT-PCR assays were able to detect all local CSF viruses circulated in Serbia in the last years during intensive vaccination campaign against CSF.
Klasična kuga svinja (CSF) je visoko kontagiozno oboljenje svinja koje dovodi do značajnih ekonomskih gubitaka širom sveta. Na osnovu genetske strukture, virus klasicne kuge svinja podeljen je utri genogrupe, od kojih svaka ima tri ili četiri podgrupe. Nedostaju podaci o tome koji genotipovi virusa klasične kuge svinja na teritoriji Republike Srbije cirkulišu u prijemčivoj populaciji. Sekvencioniranjem dela E2 gena i 5’nekodirajućeg regiona (NCR) 15 izolata virusa klasične kuge svinja prikupljenih u periodu od 2006-2008 godine, poreklom od domaćih svinja, dokazano je da svi pripadaju genetskoj grupi 2.3. Uz to, dokazano je i da je upotrebom dva najčešće korišćena real time RT-PCR protokola moguće detektovati sve lokalne izolate virusa klasične kuge svinja koji cirkulišu u Srbiji poslednjih godina, u kojoj se uporedo vršila i intenzivna vakcinacija protiv ove bolesti.
Ključne reči:
Classical swine fever virus / genotyping / real time RT- PCR / SerbiaIzvor:
Acta Veterinaria-Beograd, 2013, 63, 2-3, 191-200Izdavač:
- Univerzitet u Beogradu - Fakultet veterinarske medicine, Beograd
Finansiranje / projekti:
- Unapređenje proizvodnih kapaciteta šarana (Cyprinus carpio L) programima ishrane i selekcije (RS-31075)
- Razvoj i standardizacija molekularnih i imunskih metoda u dijagnostici bakterijskih zoonoza (RS-31088)
DOI: 10.2298/AVB1303191M
ISSN: 0567-8315
WoS: 000321027000006
Scopus: 2-s2.0-84880533626
Kolekcije
Institucija/grupa
Fakultet veterinarske medicineTY - JOUR AU - Milićević, Vesna AU - Radojičić, Sonja AU - Valčić, Miroslav AU - Ivović, V. AU - Maksimović-Zorić, Jelena AU - Radosavljević, Vladimir PY - 2013 UR - https://vet-erinar.vet.bg.ac.rs/handle/123456789/1065 AB - Classical swine fever (CSF) is a highly contagious disease of pigs leading to significant economic losses worldwide. Classical swine fever virus can be classified into three genogroups, each consisting of three or four subgroups. However, there is a lack of knowledge on the genotypes of CSFV isolates in Republic of Serbia. This study, based on the sequences analysis of partial E2 gene and 5' non coding region (NCR) of 15 CSFV isolated during 2006-2008 from domestic pigs, revealed that all were clustered into genetic group 2.3. Additionally, we showed that the two most often used real time RT-PCR assays were able to detect all local CSF viruses circulated in Serbia in the last years during intensive vaccination campaign against CSF. AB - Klasična kuga svinja (CSF) je visoko kontagiozno oboljenje svinja koje dovodi do značajnih ekonomskih gubitaka širom sveta. Na osnovu genetske strukture, virus klasicne kuge svinja podeljen je utri genogrupe, od kojih svaka ima tri ili četiri podgrupe. Nedostaju podaci o tome koji genotipovi virusa klasične kuge svinja na teritoriji Republike Srbije cirkulišu u prijemčivoj populaciji. Sekvencioniranjem dela E2 gena i 5’nekodirajućeg regiona (NCR) 15 izolata virusa klasične kuge svinja prikupljenih u periodu od 2006-2008 godine, poreklom od domaćih svinja, dokazano je da svi pripadaju genetskoj grupi 2.3. Uz to, dokazano je i da je upotrebom dva najčešće korišćena real time RT-PCR protokola moguće detektovati sve lokalne izolate virusa klasične kuge svinja koji cirkulišu u Srbiji poslednjih godina, u kojoj se uporedo vršila i intenzivna vakcinacija protiv ove bolesti. PB - Univerzitet u Beogradu - Fakultet veterinarske medicine, Beograd T2 - Acta Veterinaria-Beograd T1 - Detection and genotyping of classical swine fever virus isolates in Serbia T1 - Detekcija i genotipizacija izolata virusa klasične kuge svinja u Srbiji VL - 63 IS - 2-3 SP - 191 EP - 200 DO - 10.2298/AVB1303191M ER -
@article{ author = "Milićević, Vesna and Radojičić, Sonja and Valčić, Miroslav and Ivović, V. and Maksimović-Zorić, Jelena and Radosavljević, Vladimir", year = "2013", abstract = "Classical swine fever (CSF) is a highly contagious disease of pigs leading to significant economic losses worldwide. Classical swine fever virus can be classified into three genogroups, each consisting of three or four subgroups. However, there is a lack of knowledge on the genotypes of CSFV isolates in Republic of Serbia. This study, based on the sequences analysis of partial E2 gene and 5' non coding region (NCR) of 15 CSFV isolated during 2006-2008 from domestic pigs, revealed that all were clustered into genetic group 2.3. Additionally, we showed that the two most often used real time RT-PCR assays were able to detect all local CSF viruses circulated in Serbia in the last years during intensive vaccination campaign against CSF., Klasična kuga svinja (CSF) je visoko kontagiozno oboljenje svinja koje dovodi do značajnih ekonomskih gubitaka širom sveta. Na osnovu genetske strukture, virus klasicne kuge svinja podeljen je utri genogrupe, od kojih svaka ima tri ili četiri podgrupe. Nedostaju podaci o tome koji genotipovi virusa klasične kuge svinja na teritoriji Republike Srbije cirkulišu u prijemčivoj populaciji. Sekvencioniranjem dela E2 gena i 5’nekodirajućeg regiona (NCR) 15 izolata virusa klasične kuge svinja prikupljenih u periodu od 2006-2008 godine, poreklom od domaćih svinja, dokazano je da svi pripadaju genetskoj grupi 2.3. Uz to, dokazano je i da je upotrebom dva najčešće korišćena real time RT-PCR protokola moguće detektovati sve lokalne izolate virusa klasične kuge svinja koji cirkulišu u Srbiji poslednjih godina, u kojoj se uporedo vršila i intenzivna vakcinacija protiv ove bolesti.", publisher = "Univerzitet u Beogradu - Fakultet veterinarske medicine, Beograd", journal = "Acta Veterinaria-Beograd", title = "Detection and genotyping of classical swine fever virus isolates in Serbia, Detekcija i genotipizacija izolata virusa klasične kuge svinja u Srbiji", volume = "63", number = "2-3", pages = "191-200", doi = "10.2298/AVB1303191M" }
Milićević, V., Radojičić, S., Valčić, M., Ivović, V., Maksimović-Zorić, J.,& Radosavljević, V.. (2013). Detection and genotyping of classical swine fever virus isolates in Serbia. in Acta Veterinaria-Beograd Univerzitet u Beogradu - Fakultet veterinarske medicine, Beograd., 63(2-3), 191-200. https://doi.org/10.2298/AVB1303191M
Milićević V, Radojičić S, Valčić M, Ivović V, Maksimović-Zorić J, Radosavljević V. Detection and genotyping of classical swine fever virus isolates in Serbia. in Acta Veterinaria-Beograd. 2013;63(2-3):191-200. doi:10.2298/AVB1303191M .
Milićević, Vesna, Radojičić, Sonja, Valčić, Miroslav, Ivović, V., Maksimović-Zorić, Jelena, Radosavljević, Vladimir, "Detection and genotyping of classical swine fever virus isolates in Serbia" in Acta Veterinaria-Beograd, 63, no. 2-3 (2013):191-200, https://doi.org/10.2298/AVB1303191M . .