Molecular detection of PCV2 and PPV in pigs in Republic of Srpska, Bosnia and Herzegovina
Molekularna detekcija PCV2 i PPV kod svinja u Republici Srpskoj, Bosna i Hercegovina
2016
Аутори
Lukač, BojanKnežević, Aleksandra
Milić, Nenad
Krnjaić, Dejan
Veljović, Ljubiša
Milićević, Vesna
Zorić, Andrea
Đurić, Spomenka
Stanojević, Maja
Nišavić, Jakov
Чланак у часопису (Објављена верзија)
Метаподаци
Приказ свих података о документуАпстракт
The presence of porcine circovirus 2 and porcine parvovirus was examined in forty clinical samples of spleen, lymph nodes and lungs originating from non-vaccinated swine by polymerase chain reaction. All animals were reared in extensive livestock farming systems in different geographical districts of Republic of Srpska, Bosnia and Herzegovina. Porcine circovirus 2 DNA was detected in four lymph node and two spleen samples (15%), while porcine parvovirus DNA was identified in five lymph node samples (12.5%). The presence of both viruses was detected in three lymph node samples (7.5%). Partial nucleotide sequence of ORF1 gene of 2 porcine circovirus 2 and VP2 gene of 2 porcine parvovirus isolates was determined. The nucleotide sequences of two PCV2 isolates from RS-BIH included in phylogenetic typing are similar and cluster together with the strain Mantova isolated from domestic pigs in Italy, strains DE006-14 and DE222-13 isolated from pigs in Germany as well as with the strain Jvnan is...olated from pigs in China. Also, analyzed PCV2 isolates were partially similar to the strain NIV-C SRB isolated from pigs in Serbia. The nucleotide sequences of two PPV isolates that were included in phylogenetic typing showed a high level of similarity with the strain Challenge isolated from pigs in UK, strain Kresse isolated from pigs in USA and strains 77 and LZ isolated from pigs in China.
Prisustvo svinjskog cirkovirusa 2 i parvovirusa svinja ispitano je u četrdeset uzoraka (slezina, limfni čvorovi, pluća) poreklom od nevakcinisanih svinja primenom lančane reakcije polimeraze. Sve životinje su bile iz ekstenzivnog načina gajenja i iz različitih regiona Republike Srpske, BiH. Četiri uzorka limfnih čvorova i dva uzorka slezine su bili pozitivni na prisustvo DNK svinjskog cirkovirusa 2 (15%), dok je kod pet uzoraka limfnih čvorova utvrđeno prisustvo DNK parvovirusa svinja (12.5%). U uzorcima poreklom od tri svinje utvrđeno je prisustvo nukleinske kiseline oba prethodno navedena virusa (7.5%). Metodom sekvenciranja određena je nukleotidna sekvenca dela ORF1 gena dva izolata svinjskog cirkovirusa 2 i dela VP2 gena dva izolata parvovirusa svinja. Nukleotidne sekvence dva izolata PCV2 utvrđena u uzorcima svinja poreklom iz RS-BiH koja su bila uključena u filogenetsku analizu su pokazale visok stepen sličnosti sa nukleotidnim sekvencama soja Mantova izolovanog kod svinja u Ital...iji, zatim sojeva DE006-14 i DE222-13 izolovanih kod svinja u Nemačkoj kao i sa sojem Jvnan izolovanog kod svinja u Kini. Istovremeno, izolati PCV2 utvrđeni kod svinja u RS-BiH su bili delimično slični sa sojem NIV-C SRB virusa PCV2 izolovanim kod svinja u Srbiji. Nukleotidne sekvence dva izolata parvovirusa svinja uključenih u filogenetsku analizu su pokazale visok stepen sličnosti sa sojem Challenge izolovanim kod svinja u UK, sojem Kresse izolovanim kod svinja u SAD-u kao i sojevima 77 i LZ izolovanim kod svinja u Kini.
Кључне речи:
porcine circovirus 2 / porcine parvovirus / nucleotide sequence / Republic of Srpska / Bosnia and HerzegovinaИзвор:
Acta Veterinaria-Beograd, 2016, 66, 1, 51-60Издавач:
- Univerzitet u Beogradu - Fakultet veterinarske medicine, Beograd
Финансирање / пројекти:
- Развој и примена молекуларних метода заснованих на ланчаној реакцији полимеразе (PCR) у брзој и директној идентификацији сојева вируса Неwцастле болести живине и испитивање имуногености субјединичне вакцине припремљене од њихових антигена (RS-31008)
- Физиолошка, хемијска и молекуларна анализа диверзитета одабраних ретких и угрожених биљних врста у циљу еx ситу заштите и продукције биолошки активних једињења (RS-173024)
DOI: 10.1515/acve-2016-0004
ISSN: 0567-8315
WoS: 000377780400004
Scopus: 2-s2.0-84962911160
Колекције
Институција/група
Fakultet veterinarske medicineTY - JOUR AU - Lukač, Bojan AU - Knežević, Aleksandra AU - Milić, Nenad AU - Krnjaić, Dejan AU - Veljović, Ljubiša AU - Milićević, Vesna AU - Zorić, Andrea AU - Đurić, Spomenka AU - Stanojević, Maja AU - Nišavić, Jakov PY - 2016 UR - https://vet-erinar.vet.bg.ac.rs/handle/123456789/1352 AB - The presence of porcine circovirus 2 and porcine parvovirus was examined in forty clinical samples of spleen, lymph nodes and lungs originating from non-vaccinated swine by polymerase chain reaction. All animals were reared in extensive livestock farming systems in different geographical districts of Republic of Srpska, Bosnia and Herzegovina. Porcine circovirus 2 DNA was detected in four lymph node and two spleen samples (15%), while porcine parvovirus DNA was identified in five lymph node samples (12.5%). The presence of both viruses was detected in three lymph node samples (7.5%). Partial nucleotide sequence of ORF1 gene of 2 porcine circovirus 2 and VP2 gene of 2 porcine parvovirus isolates was determined. The nucleotide sequences of two PCV2 isolates from RS-BIH included in phylogenetic typing are similar and cluster together with the strain Mantova isolated from domestic pigs in Italy, strains DE006-14 and DE222-13 isolated from pigs in Germany as well as with the strain Jvnan isolated from pigs in China. Also, analyzed PCV2 isolates were partially similar to the strain NIV-C SRB isolated from pigs in Serbia. The nucleotide sequences of two PPV isolates that were included in phylogenetic typing showed a high level of similarity with the strain Challenge isolated from pigs in UK, strain Kresse isolated from pigs in USA and strains 77 and LZ isolated from pigs in China. AB - Prisustvo svinjskog cirkovirusa 2 i parvovirusa svinja ispitano je u četrdeset uzoraka (slezina, limfni čvorovi, pluća) poreklom od nevakcinisanih svinja primenom lančane reakcije polimeraze. Sve životinje su bile iz ekstenzivnog načina gajenja i iz različitih regiona Republike Srpske, BiH. Četiri uzorka limfnih čvorova i dva uzorka slezine su bili pozitivni na prisustvo DNK svinjskog cirkovirusa 2 (15%), dok je kod pet uzoraka limfnih čvorova utvrđeno prisustvo DNK parvovirusa svinja (12.5%). U uzorcima poreklom od tri svinje utvrđeno je prisustvo nukleinske kiseline oba prethodno navedena virusa (7.5%). Metodom sekvenciranja određena je nukleotidna sekvenca dela ORF1 gena dva izolata svinjskog cirkovirusa 2 i dela VP2 gena dva izolata parvovirusa svinja. Nukleotidne sekvence dva izolata PCV2 utvrđena u uzorcima svinja poreklom iz RS-BiH koja su bila uključena u filogenetsku analizu su pokazale visok stepen sličnosti sa nukleotidnim sekvencama soja Mantova izolovanog kod svinja u Italiji, zatim sojeva DE006-14 i DE222-13 izolovanih kod svinja u Nemačkoj kao i sa sojem Jvnan izolovanog kod svinja u Kini. Istovremeno, izolati PCV2 utvrđeni kod svinja u RS-BiH su bili delimično slični sa sojem NIV-C SRB virusa PCV2 izolovanim kod svinja u Srbiji. Nukleotidne sekvence dva izolata parvovirusa svinja uključenih u filogenetsku analizu su pokazale visok stepen sličnosti sa sojem Challenge izolovanim kod svinja u UK, sojem Kresse izolovanim kod svinja u SAD-u kao i sojevima 77 i LZ izolovanim kod svinja u Kini. PB - Univerzitet u Beogradu - Fakultet veterinarske medicine, Beograd T2 - Acta Veterinaria-Beograd T1 - Molecular detection of PCV2 and PPV in pigs in Republic of Srpska, Bosnia and Herzegovina T1 - Molekularna detekcija PCV2 i PPV kod svinja u Republici Srpskoj, Bosna i Hercegovina VL - 66 IS - 1 SP - 51 EP - 60 DO - 10.1515/acve-2016-0004 ER -
@article{ author = "Lukač, Bojan and Knežević, Aleksandra and Milić, Nenad and Krnjaić, Dejan and Veljović, Ljubiša and Milićević, Vesna and Zorić, Andrea and Đurić, Spomenka and Stanojević, Maja and Nišavić, Jakov", year = "2016", abstract = "The presence of porcine circovirus 2 and porcine parvovirus was examined in forty clinical samples of spleen, lymph nodes and lungs originating from non-vaccinated swine by polymerase chain reaction. All animals were reared in extensive livestock farming systems in different geographical districts of Republic of Srpska, Bosnia and Herzegovina. Porcine circovirus 2 DNA was detected in four lymph node and two spleen samples (15%), while porcine parvovirus DNA was identified in five lymph node samples (12.5%). The presence of both viruses was detected in three lymph node samples (7.5%). Partial nucleotide sequence of ORF1 gene of 2 porcine circovirus 2 and VP2 gene of 2 porcine parvovirus isolates was determined. The nucleotide sequences of two PCV2 isolates from RS-BIH included in phylogenetic typing are similar and cluster together with the strain Mantova isolated from domestic pigs in Italy, strains DE006-14 and DE222-13 isolated from pigs in Germany as well as with the strain Jvnan isolated from pigs in China. Also, analyzed PCV2 isolates were partially similar to the strain NIV-C SRB isolated from pigs in Serbia. The nucleotide sequences of two PPV isolates that were included in phylogenetic typing showed a high level of similarity with the strain Challenge isolated from pigs in UK, strain Kresse isolated from pigs in USA and strains 77 and LZ isolated from pigs in China., Prisustvo svinjskog cirkovirusa 2 i parvovirusa svinja ispitano je u četrdeset uzoraka (slezina, limfni čvorovi, pluća) poreklom od nevakcinisanih svinja primenom lančane reakcije polimeraze. Sve životinje su bile iz ekstenzivnog načina gajenja i iz različitih regiona Republike Srpske, BiH. Četiri uzorka limfnih čvorova i dva uzorka slezine su bili pozitivni na prisustvo DNK svinjskog cirkovirusa 2 (15%), dok je kod pet uzoraka limfnih čvorova utvrđeno prisustvo DNK parvovirusa svinja (12.5%). U uzorcima poreklom od tri svinje utvrđeno je prisustvo nukleinske kiseline oba prethodno navedena virusa (7.5%). Metodom sekvenciranja određena je nukleotidna sekvenca dela ORF1 gena dva izolata svinjskog cirkovirusa 2 i dela VP2 gena dva izolata parvovirusa svinja. Nukleotidne sekvence dva izolata PCV2 utvrđena u uzorcima svinja poreklom iz RS-BiH koja su bila uključena u filogenetsku analizu su pokazale visok stepen sličnosti sa nukleotidnim sekvencama soja Mantova izolovanog kod svinja u Italiji, zatim sojeva DE006-14 i DE222-13 izolovanih kod svinja u Nemačkoj kao i sa sojem Jvnan izolovanog kod svinja u Kini. Istovremeno, izolati PCV2 utvrđeni kod svinja u RS-BiH su bili delimično slični sa sojem NIV-C SRB virusa PCV2 izolovanim kod svinja u Srbiji. Nukleotidne sekvence dva izolata parvovirusa svinja uključenih u filogenetsku analizu su pokazale visok stepen sličnosti sa sojem Challenge izolovanim kod svinja u UK, sojem Kresse izolovanim kod svinja u SAD-u kao i sojevima 77 i LZ izolovanim kod svinja u Kini.", publisher = "Univerzitet u Beogradu - Fakultet veterinarske medicine, Beograd", journal = "Acta Veterinaria-Beograd", title = "Molecular detection of PCV2 and PPV in pigs in Republic of Srpska, Bosnia and Herzegovina, Molekularna detekcija PCV2 i PPV kod svinja u Republici Srpskoj, Bosna i Hercegovina", volume = "66", number = "1", pages = "51-60", doi = "10.1515/acve-2016-0004" }
Lukač, B., Knežević, A., Milić, N., Krnjaić, D., Veljović, L., Milićević, V., Zorić, A., Đurić, S., Stanojević, M.,& Nišavić, J.. (2016). Molecular detection of PCV2 and PPV in pigs in Republic of Srpska, Bosnia and Herzegovina. in Acta Veterinaria-Beograd Univerzitet u Beogradu - Fakultet veterinarske medicine, Beograd., 66(1), 51-60. https://doi.org/10.1515/acve-2016-0004
Lukač B, Knežević A, Milić N, Krnjaić D, Veljović L, Milićević V, Zorić A, Đurić S, Stanojević M, Nišavić J. Molecular detection of PCV2 and PPV in pigs in Republic of Srpska, Bosnia and Herzegovina. in Acta Veterinaria-Beograd. 2016;66(1):51-60. doi:10.1515/acve-2016-0004 .
Lukač, Bojan, Knežević, Aleksandra, Milić, Nenad, Krnjaić, Dejan, Veljović, Ljubiša, Milićević, Vesna, Zorić, Andrea, Đurić, Spomenka, Stanojević, Maja, Nišavić, Jakov, "Molecular detection of PCV2 and PPV in pigs in Republic of Srpska, Bosnia and Herzegovina" in Acta Veterinaria-Beograd, 66, no. 1 (2016):51-60, https://doi.org/10.1515/acve-2016-0004 . .