Effective population size in Busha and Gatačko cattle from Herzegovina: ecological and molecular approach

Abstract

Efektivna veličina populacije (Ne) je jedan od osnovnih parametarapopulacione genetike. Praćenje efektivne veličine populacije zajedno sa praćenjemgenetičke varijabilnosti je veoma značajno za populaciono genetička istraživanja i imaveliku primjenu u uspostavljanju konzervacione strategije. U radu je izračunata Ne zapopulaciju buše sa dva lokaliteta (istočna i zapadna Hercegovina) i populacijugatačkog govečeta iz regije Hercegovina. Korišćene su dvije metode za računanje Ne ito: ekološka i molekularna metoda. Za ekološku metodu izračunavanja efektivneveličine populacije korišćen je broj mužjaka i ženki koje se pare. Ne premamolekularnim metodama je računata na osnovu varijacije broja ponovaka (SSMM),kao i na osnovu očekivane heterozigotnosti (IAM). Ekološka Ne je u odnosu na cenzus(N) u opsegu očekivanom za populacije goveda i kretala se od 7,5 do 18,5.Molekularna Ne prema IAM metodi se kretala od 3040 do 3947, a prema SSMMmetodi se kretala od 28875 do 35196. Dobijeni rezultati ukazuju na značajmolekularnih metoda u ocjeni Ne kao parametra u konzervaciji autohtonih goveda.

The effective population size (Ne) is one of basic core concepts in population genetics. Monitoring the effective population size, which is parallel to monitoring genetic variability, is of importance to population genetic studies and is applicable in conservation strategies. In this study Ne was estimated for two population of Busha from two locations (eastern and western Herzegovina) and population of Gatačko cattle from Herzegovina region. Two methods were used to estimate Ne: ecological and molecular. The ecological method of estimating effective population size used the number of males and females used in breeding. Molecular methods for estimating Ne used data of variance of repeat number (SSMM), and the expected heterozigosity (IAM). The obtained ecological Ne (7,5 to 18,5) as proportional to census is within the range expected for cattle. Molecular Ne according to the IAM method ranged from 3040 to 3947, and according to the SSMM method ranged from 28875 to 35196. The results indicate the importance of molecular methods in the assessment of Ne as valuable parameter in conservation of autochthonous cattle species.