Molekularna karakterizacija i filogenetska analiza sojeva goveđeg herpesvirusa 1 (BHV-1) izolovanih kod goveda na teritoriji Republike Srbije
Molecular Characterization and Phylogenetic Analysis of Bovine Herpesvirus 1 (BHV-1) Strains Isolated From Cattle in the Republic of Serbia
Апстракт
UVOD: Goveđi herpesvirus 1 (BHV-1) pripada rodu Varicellovirus, podfamiliji Alphaherpesvirinae
i familiji Herpesviridae. Kod goveda izaziva infektivni goveđi rinotraheitis, odnosno infektivni
pustulozni vulvovaginitis. Virus izaziva značajne ekonomske štete u govedarstvu.
CILJ: Cilj ispitivanja je bila molekularna detekcija i karakterizacija sojeva BHV-1 izolovanih kod
goveda na teritoriji Republike Srbije i upoređivanje dobijenih sekvenci sa analognim sekvencama
sojeva BHV-1 iz drugih geografskih regiona.
METOD: Ispitano je 110 uzoraka nosnih briseva poreklom od nevakcinisanih goveda iz različitih
regiona u Republici Srbiji. Izolacija i identifikacija virusa BHV-1 vršena je korišćenjem ćelijske
linije Vero. Metoda PCR je izvođena uz korišćenje prajmera za delove gena koji kodiraju sintezu
glikoproteina B (gB) i timidin-kinaze (TK) BHV-1. Određivanje redosleda nukleotida dela TK i gB
gena BHV-1 je vršena metodom direktnog sekvenciranja po Sanger-u, a dobijene nukleotidne
sek...vence su upoređivane sa analognim sekvencama delova prethodno navedenih gena
referentnih i izolovanih sojeva BHV-1 dostupnih u banci gena
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/).
REZULTAT: Primenom metoda izolacije virusa i PCR, utvrđeno je prisustvo BHV-1 kod četiri
uzorka nosnih briseva goveda. Filogenetska analiza dela gB gena je pokazala da su nukleotidne
sekvence sojeva BHV-1 poreklom iz Srbije grupisane zajedno sa sojevima virusa poreklom iz
Egipta i SAD. Nukleotidne sekvence dela TK gena četiri izolovana soja BHV-1 poreklom iz Srbije
su međusobno imale visok stepen sličnosti i grupisane su zajedno na filogenetskom stablu,
odnosno sa sojevima virusa poreklom iz SAD i Australije.
ZAKLJUČAK: Dobijeni rezultati su pokazali visok stepen sličnosti između sojeva BHV-1 poreklom
iz Srbije i sojeva navedenog virusa poreklom iz drugih delova sveta. Pored toga, rezultati
navedenih ispitivanja su ukazali na potrebu daljih opsežnijih istraživanja koja bi imala za cilj
utvrđivanje prevalencije i molekularnih karakteristika sojeva BHV-1 kod goveda na teritoriji
Republike Srbije.
INTRODUCTION: Bovine herpesvirus 1 (BHV-1) is a member of the genus Varicellovirus of the
Alphaherpesvirinae subfamily and Herpesviridae family. It is an important bovine pathogen
causing infectious bovine rinotracheitis and infectious pustular vulvovaginitis and leads to major
economic losses in the cattle industry.
AIM: Molecular detection and characterization of BHV-1 strains isolated from cattle originating
from The Republic of Serbia and the comparison of obtained sequences with viral sequences from
other geographic regions.
METHOD: A total of 110 nasal swabs from non-vaccinated animals raised in different regions of
Serbia were examined. Vero cell line was used for virus isolation and identification. PCR was
performed using primers for the parts of the BHV-1 genome coding the synthesis of glycoprotein
B (gB) and thymidine kinase (TK). Partial sequencing of glycoprotein B (gB) and thymidine kinase
(TK) genes of BHV-1 was performed according to Sanger sequencing method a...nd the obtained
nucleotide sequences were compared to analogous sequences of the mentioned genes available
in GenBank database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/).
RESULT: BHV-1 was detected in four samples using virus isolation and PCR. The phylogenetic
analysis of partial glycoprotein B (gB) gene nucleotide sequences of all four BHV-1 strains showed
the clustering with BHV-1 strains isolated in Egypt and USA. Partial TK gene nucleotide sequences
of Serbian BHV-1 strains were highly similar and grouped together in one branch along with BHV-
1 strains from USA and Australia.
CONCLUSION: The obtained results showed a high level of similarity between BHV-1 strains from
Serbia and other parts of the world. Moreover, these results provide a prerequisite for further
detailed investigations aimed to establish the prevalence and molecular characteristics of BHV-1
strains in The Republic of Serbia.
Кључне речи:
BHV-1 / molekularna karakterizacija / molecular characterizationИзвор:
XII Kongres mikrobiologa Srbije sa međunarodnim učešćem – Mikromed 2018 REGIO, 2018, 151-152Издавач:
- Udruženje mikrobiologa Srbije, Beograd
Колекције
Институција/група
Fakultet veterinarske medicineTY - CONF AU - Nišavić, Jakov AU - Milić, Nenad AU - Radalj, Andrea AU - Knežević, Aleksandra PY - 2018 UR - https://vet-erinar.vet.bg.ac.rs/handle/123456789/2269 AB - UVOD: Goveđi herpesvirus 1 (BHV-1) pripada rodu Varicellovirus, podfamiliji Alphaherpesvirinae i familiji Herpesviridae. Kod goveda izaziva infektivni goveđi rinotraheitis, odnosno infektivni pustulozni vulvovaginitis. Virus izaziva značajne ekonomske štete u govedarstvu. CILJ: Cilj ispitivanja je bila molekularna detekcija i karakterizacija sojeva BHV-1 izolovanih kod goveda na teritoriji Republike Srbije i upoređivanje dobijenih sekvenci sa analognim sekvencama sojeva BHV-1 iz drugih geografskih regiona. METOD: Ispitano je 110 uzoraka nosnih briseva poreklom od nevakcinisanih goveda iz različitih regiona u Republici Srbiji. Izolacija i identifikacija virusa BHV-1 vršena je korišćenjem ćelijske linije Vero. Metoda PCR je izvođena uz korišćenje prajmera za delove gena koji kodiraju sintezu glikoproteina B (gB) i timidin-kinaze (TK) BHV-1. Određivanje redosleda nukleotida dela TK i gB gena BHV-1 je vršena metodom direktnog sekvenciranja po Sanger-u, a dobijene nukleotidne sekvence su upoređivane sa analognim sekvencama delova prethodno navedenih gena referentnih i izolovanih sojeva BHV-1 dostupnih u banci gena (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/). REZULTAT: Primenom metoda izolacije virusa i PCR, utvrđeno je prisustvo BHV-1 kod četiri uzorka nosnih briseva goveda. Filogenetska analiza dela gB gena je pokazala da su nukleotidne sekvence sojeva BHV-1 poreklom iz Srbije grupisane zajedno sa sojevima virusa poreklom iz Egipta i SAD. Nukleotidne sekvence dela TK gena četiri izolovana soja BHV-1 poreklom iz Srbije su međusobno imale visok stepen sličnosti i grupisane su zajedno na filogenetskom stablu, odnosno sa sojevima virusa poreklom iz SAD i Australije. ZAKLJUČAK: Dobijeni rezultati su pokazali visok stepen sličnosti između sojeva BHV-1 poreklom iz Srbije i sojeva navedenog virusa poreklom iz drugih delova sveta. Pored toga, rezultati navedenih ispitivanja su ukazali na potrebu daljih opsežnijih istraživanja koja bi imala za cilj utvrđivanje prevalencije i molekularnih karakteristika sojeva BHV-1 kod goveda na teritoriji Republike Srbije. AB - INTRODUCTION: Bovine herpesvirus 1 (BHV-1) is a member of the genus Varicellovirus of the Alphaherpesvirinae subfamily and Herpesviridae family. It is an important bovine pathogen causing infectious bovine rinotracheitis and infectious pustular vulvovaginitis and leads to major economic losses in the cattle industry. AIM: Molecular detection and characterization of BHV-1 strains isolated from cattle originating from The Republic of Serbia and the comparison of obtained sequences with viral sequences from other geographic regions. METHOD: A total of 110 nasal swabs from non-vaccinated animals raised in different regions of Serbia were examined. Vero cell line was used for virus isolation and identification. PCR was performed using primers for the parts of the BHV-1 genome coding the synthesis of glycoprotein B (gB) and thymidine kinase (TK). Partial sequencing of glycoprotein B (gB) and thymidine kinase (TK) genes of BHV-1 was performed according to Sanger sequencing method and the obtained nucleotide sequences were compared to analogous sequences of the mentioned genes available in GenBank database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/). RESULT: BHV-1 was detected in four samples using virus isolation and PCR. The phylogenetic analysis of partial glycoprotein B (gB) gene nucleotide sequences of all four BHV-1 strains showed the clustering with BHV-1 strains isolated in Egypt and USA. Partial TK gene nucleotide sequences of Serbian BHV-1 strains were highly similar and grouped together in one branch along with BHV- 1 strains from USA and Australia. CONCLUSION: The obtained results showed a high level of similarity between BHV-1 strains from Serbia and other parts of the world. Moreover, these results provide a prerequisite for further detailed investigations aimed to establish the prevalence and molecular characteristics of BHV-1 strains in The Republic of Serbia. PB - Udruženje mikrobiologa Srbije, Beograd C3 - XII Kongres mikrobiologa Srbije sa međunarodnim učešćem – Mikromed 2018 REGIO T1 - Molekularna karakterizacija i filogenetska analiza sojeva goveđeg herpesvirusa 1 (BHV-1) izolovanih kod goveda na teritoriji Republike Srbije T1 - Molecular Characterization and Phylogenetic Analysis of Bovine Herpesvirus 1 (BHV-1) Strains Isolated From Cattle in the Republic of Serbia SP - 151 EP - 152 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_2269 ER -
@conference{ author = "Nišavić, Jakov and Milić, Nenad and Radalj, Andrea and Knežević, Aleksandra", year = "2018", abstract = "UVOD: Goveđi herpesvirus 1 (BHV-1) pripada rodu Varicellovirus, podfamiliji Alphaherpesvirinae i familiji Herpesviridae. Kod goveda izaziva infektivni goveđi rinotraheitis, odnosno infektivni pustulozni vulvovaginitis. Virus izaziva značajne ekonomske štete u govedarstvu. CILJ: Cilj ispitivanja je bila molekularna detekcija i karakterizacija sojeva BHV-1 izolovanih kod goveda na teritoriji Republike Srbije i upoređivanje dobijenih sekvenci sa analognim sekvencama sojeva BHV-1 iz drugih geografskih regiona. METOD: Ispitano je 110 uzoraka nosnih briseva poreklom od nevakcinisanih goveda iz različitih regiona u Republici Srbiji. Izolacija i identifikacija virusa BHV-1 vršena je korišćenjem ćelijske linije Vero. Metoda PCR je izvođena uz korišćenje prajmera za delove gena koji kodiraju sintezu glikoproteina B (gB) i timidin-kinaze (TK) BHV-1. Određivanje redosleda nukleotida dela TK i gB gena BHV-1 je vršena metodom direktnog sekvenciranja po Sanger-u, a dobijene nukleotidne sekvence su upoređivane sa analognim sekvencama delova prethodno navedenih gena referentnih i izolovanih sojeva BHV-1 dostupnih u banci gena (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/). REZULTAT: Primenom metoda izolacije virusa i PCR, utvrđeno je prisustvo BHV-1 kod četiri uzorka nosnih briseva goveda. Filogenetska analiza dela gB gena je pokazala da su nukleotidne sekvence sojeva BHV-1 poreklom iz Srbije grupisane zajedno sa sojevima virusa poreklom iz Egipta i SAD. Nukleotidne sekvence dela TK gena četiri izolovana soja BHV-1 poreklom iz Srbije su međusobno imale visok stepen sličnosti i grupisane su zajedno na filogenetskom stablu, odnosno sa sojevima virusa poreklom iz SAD i Australije. ZAKLJUČAK: Dobijeni rezultati su pokazali visok stepen sličnosti između sojeva BHV-1 poreklom iz Srbije i sojeva navedenog virusa poreklom iz drugih delova sveta. Pored toga, rezultati navedenih ispitivanja su ukazali na potrebu daljih opsežnijih istraživanja koja bi imala za cilj utvrđivanje prevalencije i molekularnih karakteristika sojeva BHV-1 kod goveda na teritoriji Republike Srbije., INTRODUCTION: Bovine herpesvirus 1 (BHV-1) is a member of the genus Varicellovirus of the Alphaherpesvirinae subfamily and Herpesviridae family. It is an important bovine pathogen causing infectious bovine rinotracheitis and infectious pustular vulvovaginitis and leads to major economic losses in the cattle industry. AIM: Molecular detection and characterization of BHV-1 strains isolated from cattle originating from The Republic of Serbia and the comparison of obtained sequences with viral sequences from other geographic regions. METHOD: A total of 110 nasal swabs from non-vaccinated animals raised in different regions of Serbia were examined. Vero cell line was used for virus isolation and identification. PCR was performed using primers for the parts of the BHV-1 genome coding the synthesis of glycoprotein B (gB) and thymidine kinase (TK). Partial sequencing of glycoprotein B (gB) and thymidine kinase (TK) genes of BHV-1 was performed according to Sanger sequencing method and the obtained nucleotide sequences were compared to analogous sequences of the mentioned genes available in GenBank database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/). RESULT: BHV-1 was detected in four samples using virus isolation and PCR. The phylogenetic analysis of partial glycoprotein B (gB) gene nucleotide sequences of all four BHV-1 strains showed the clustering with BHV-1 strains isolated in Egypt and USA. Partial TK gene nucleotide sequences of Serbian BHV-1 strains were highly similar and grouped together in one branch along with BHV- 1 strains from USA and Australia. CONCLUSION: The obtained results showed a high level of similarity between BHV-1 strains from Serbia and other parts of the world. Moreover, these results provide a prerequisite for further detailed investigations aimed to establish the prevalence and molecular characteristics of BHV-1 strains in The Republic of Serbia.", publisher = "Udruženje mikrobiologa Srbije, Beograd", journal = "XII Kongres mikrobiologa Srbije sa međunarodnim učešćem – Mikromed 2018 REGIO", title = "Molekularna karakterizacija i filogenetska analiza sojeva goveđeg herpesvirusa 1 (BHV-1) izolovanih kod goveda na teritoriji Republike Srbije, Molecular Characterization and Phylogenetic Analysis of Bovine Herpesvirus 1 (BHV-1) Strains Isolated From Cattle in the Republic of Serbia", pages = "151-152", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_2269" }
Nišavić, J., Milić, N., Radalj, A.,& Knežević, A.. (2018). Molekularna karakterizacija i filogenetska analiza sojeva goveđeg herpesvirusa 1 (BHV-1) izolovanih kod goveda na teritoriji Republike Srbije. in XII Kongres mikrobiologa Srbije sa međunarodnim učešćem – Mikromed 2018 REGIO Udruženje mikrobiologa Srbije, Beograd., 151-152. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_2269
Nišavić J, Milić N, Radalj A, Knežević A. Molekularna karakterizacija i filogenetska analiza sojeva goveđeg herpesvirusa 1 (BHV-1) izolovanih kod goveda na teritoriji Republike Srbije. in XII Kongres mikrobiologa Srbije sa međunarodnim učešćem – Mikromed 2018 REGIO. 2018;:151-152. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_2269 .
Nišavić, Jakov, Milić, Nenad, Radalj, Andrea, Knežević, Aleksandra, "Molekularna karakterizacija i filogenetska analiza sojeva goveđeg herpesvirusa 1 (BHV-1) izolovanih kod goveda na teritoriji Republike Srbije" in XII Kongres mikrobiologa Srbije sa međunarodnim učešćem – Mikromed 2018 REGIO (2018):151-152, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_veterinar_2269 .