Phenotypic and molecular genetic characterization of Balkan donkey population in Serbia
Fenotipska i molekularno-genetička karakterizacija populacije balkanskog magarca u Republici Srbiji
2017
Autori
Stanišić, LjubodragOstala autorstva
Stevanović, JevrosimaDimitrijević, Vladimir
Stanimirović, Zoran
Vakanjac, Slobodanka
Aleksić, Jelena M.
Doktorska teza (Objavljena verzija)
Metapodaci
Prikaz svih podataka o dokumentuApstrakt
The Balkan donkey (Equus asinus L.) is commonly regarded as endangered, large-sized, unselected, unstructured and traditionally managed donkey breed. In order to provide basis for development of the breed standard, conservation programme and breeding management, new insights into phenotypic features, current genetic status and origin of the Balkan donkey are needed. One of the goals of the study was to establish morphometric, biochemical and hematological values for the studied Balkan donkey population (Serbia) and to explore possible age dependence of the parameters tested. Inter-breed similarity of morphometric parameters was assessed by comparing the data obtained for the Balkan donkey with morphometric measurements of several previously characterized domestic donkey breeds. Furthermore, we assess the current genetic status of the three largest E. asinus populations in the central Balkans by sampling the variability within nuclear microsatellites (77 individuals) and the mitochondri...al (mtDNA) control region (49 individuals). We further analyse our mtDNA dataset along with 209 published mtDNA sequences of ancient and modern individuals from 19 European and African populations to provide new insights into the origin and the history of the Balkan donkey. The study population included 77 donkeys, divided in two age groups (group A ≤ 3 years; group B > 3 years). In total, 18 morphometric, 13 hematological and 14 biochemical parameters were assessed. Significant morphometric differences (p lt 0.05) in body length, head length, chest circumference and body weight were found between two age groups. Significant differences in morphological parameters were revealed among the Balkan donkey and other donkey breeds (Catalonian, Croatian and Albanian), but results of cluster analysis demonstrated the smallest distance between the Balkan donkey and Albanian donkeys...
Balkanski magarac (Equus asinus L.) predstavlja ugroženu, neselektovanu, nestrukturiranu i tradicionalno gajenu autohtonu rasu magaraca. Za formiranje standarda rase i implementaciju odgajivačkih, reproduktivnih i mera upravljanja koje bi omogućile očuvanje i održivu eksploataciju balkanskog magarca, neophodan je uvid u fenotipske karakteristike, genetski status i poreklo balkanskog magarca. Stoga, jedan od ciljeva istraživanja je uspostavljanje morfometrijskih, biohemijskih i hematoloških vrednosti za ispitivanu populaciju balkanskog magarca sa teritorije Srbije, kao i utvrđivanje uticaja starosti na ispitivane parametre. Među rasna sličnost morfometrijskih parametara je analizirana upoređivanjem dobijenih podataka za balkanskog magarca sa dostupnim vrednostima morfometrijskih parametara prethodno opisanih rasa magaraca. Takođe, izvršena je procena trenutnog genetičkog diverziteta i strukture tri najvec e populacije magaraca u centralnom Balkanu na osnovu varijabilnosti nuklearnih mik...rosatelita (77 jedinki) i mitohondrijskog (mtDNK) kontrolnog regiona (49 jedinki). Dobijeni podaci za kontrolni region (HVR1) mtDNK su poređeni sa 209 objavljenih sekvenci mtDNK drevnih i današnjih magaraca poreklom iz 19 evropskih i afričkih populacija da bi se obezbedio uvid u poreklo i istoriju balkanskog magarca. Ispitivana populacija se sastojala od 77 magaraca, koji su podeljeni u dve starosne grupe (A ≤ 3 godine; B > 3 godine). Ukupno, analizirano je 18 morfometrijskih, 13 hematoloških i 14 biohemijskih parametara. Između grupe A i B, uočena je značajna razlika (P lt 0.05) kod mera za dužinu tela, dužinu glave, obim grudnog koša i telesne mase...
Ključne reči:
Balkan donkey / breed characterization / blood parameters / morphological measures / nuclear microsatellites / mitochondrial control region / genetic diversity / genetic structuring / phylogeography / balkanski magarac / karakterizacija rase / parametri krvi / morfometrija / nuklearni mikrosateliti / mtDNK kontrolni region / genetički diverzitet / genetička struktura / filogeografijaIzvor:
2017Izdavač:
- Univerzitet u Beogradu, Fakultet veterinarske medicine
Finansiranje / projekti:
- Molekularno-genetička i ekofiziološka istraživanja u zaštiti autohtonih animalnih genetičkih resursa, očuvanju dobrobiti, zdravlja i reprodukcije gajenih životinja i proizvodnji bezbedne hrane (RS-MESTD-Integrated and Interdisciplinary Research (IIR or III)-46002)
URI
http://vbs.rs/scripts/cobiss?command=DISPLAY&base=70036&RID=49491983http://nardus.mpn.gov.rs/123456789/8781
https://vet-erinar.vet.bg.ac.rs/handle/123456789/40
Kolekcije
Institucija/grupa
Fakultet veterinarske medicineTY - THES AU - Stanišić, Ljubodrag PY - 2017 UR - http://vbs.rs/scripts/cobiss?command=DISPLAY&base=70036&RID=49491983 UR - http://nardus.mpn.gov.rs/123456789/8781 UR - https://vet-erinar.vet.bg.ac.rs/handle/123456789/40 AB - The Balkan donkey (Equus asinus L.) is commonly regarded as endangered, large-sized, unselected, unstructured and traditionally managed donkey breed. In order to provide basis for development of the breed standard, conservation programme and breeding management, new insights into phenotypic features, current genetic status and origin of the Balkan donkey are needed. One of the goals of the study was to establish morphometric, biochemical and hematological values for the studied Balkan donkey population (Serbia) and to explore possible age dependence of the parameters tested. Inter-breed similarity of morphometric parameters was assessed by comparing the data obtained for the Balkan donkey with morphometric measurements of several previously characterized domestic donkey breeds. Furthermore, we assess the current genetic status of the three largest E. asinus populations in the central Balkans by sampling the variability within nuclear microsatellites (77 individuals) and the mitochondrial (mtDNA) control region (49 individuals). We further analyse our mtDNA dataset along with 209 published mtDNA sequences of ancient and modern individuals from 19 European and African populations to provide new insights into the origin and the history of the Balkan donkey. The study population included 77 donkeys, divided in two age groups (group A ≤ 3 years; group B > 3 years). In total, 18 morphometric, 13 hematological and 14 biochemical parameters were assessed. Significant morphometric differences (p lt 0.05) in body length, head length, chest circumference and body weight were found between two age groups. Significant differences in morphological parameters were revealed among the Balkan donkey and other donkey breeds (Catalonian, Croatian and Albanian), but results of cluster analysis demonstrated the smallest distance between the Balkan donkey and Albanian donkeys... AB - Balkanski magarac (Equus asinus L.) predstavlja ugroženu, neselektovanu, nestrukturiranu i tradicionalno gajenu autohtonu rasu magaraca. Za formiranje standarda rase i implementaciju odgajivačkih, reproduktivnih i mera upravljanja koje bi omogućile očuvanje i održivu eksploataciju balkanskog magarca, neophodan je uvid u fenotipske karakteristike, genetski status i poreklo balkanskog magarca. Stoga, jedan od ciljeva istraživanja je uspostavljanje morfometrijskih, biohemijskih i hematoloških vrednosti za ispitivanu populaciju balkanskog magarca sa teritorije Srbije, kao i utvrđivanje uticaja starosti na ispitivane parametre. Među rasna sličnost morfometrijskih parametara je analizirana upoređivanjem dobijenih podataka za balkanskog magarca sa dostupnim vrednostima morfometrijskih parametara prethodno opisanih rasa magaraca. Takođe, izvršena je procena trenutnog genetičkog diverziteta i strukture tri najvec e populacije magaraca u centralnom Balkanu na osnovu varijabilnosti nuklearnih mikrosatelita (77 jedinki) i mitohondrijskog (mtDNK) kontrolnog regiona (49 jedinki). Dobijeni podaci za kontrolni region (HVR1) mtDNK su poređeni sa 209 objavljenih sekvenci mtDNK drevnih i današnjih magaraca poreklom iz 19 evropskih i afričkih populacija da bi se obezbedio uvid u poreklo i istoriju balkanskog magarca. Ispitivana populacija se sastojala od 77 magaraca, koji su podeljeni u dve starosne grupe (A ≤ 3 godine; B > 3 godine). Ukupno, analizirano je 18 morfometrijskih, 13 hematoloških i 14 biohemijskih parametara. Između grupe A i B, uočena je značajna razlika (P lt 0.05) kod mera za dužinu tela, dužinu glave, obim grudnog koša i telesne mase... PB - Univerzitet u Beogradu, Fakultet veterinarske medicine T1 - Phenotypic and molecular genetic characterization of Balkan donkey population in Serbia T1 - Fenotipska i molekularno-genetička karakterizacija populacije balkanskog magarca u Republici Srbiji UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_8781 ER -
@phdthesis{ author = "Stanišić, Ljubodrag", year = "2017", abstract = "The Balkan donkey (Equus asinus L.) is commonly regarded as endangered, large-sized, unselected, unstructured and traditionally managed donkey breed. In order to provide basis for development of the breed standard, conservation programme and breeding management, new insights into phenotypic features, current genetic status and origin of the Balkan donkey are needed. One of the goals of the study was to establish morphometric, biochemical and hematological values for the studied Balkan donkey population (Serbia) and to explore possible age dependence of the parameters tested. Inter-breed similarity of morphometric parameters was assessed by comparing the data obtained for the Balkan donkey with morphometric measurements of several previously characterized domestic donkey breeds. Furthermore, we assess the current genetic status of the three largest E. asinus populations in the central Balkans by sampling the variability within nuclear microsatellites (77 individuals) and the mitochondrial (mtDNA) control region (49 individuals). We further analyse our mtDNA dataset along with 209 published mtDNA sequences of ancient and modern individuals from 19 European and African populations to provide new insights into the origin and the history of the Balkan donkey. The study population included 77 donkeys, divided in two age groups (group A ≤ 3 years; group B > 3 years). In total, 18 morphometric, 13 hematological and 14 biochemical parameters were assessed. Significant morphometric differences (p lt 0.05) in body length, head length, chest circumference and body weight were found between two age groups. Significant differences in morphological parameters were revealed among the Balkan donkey and other donkey breeds (Catalonian, Croatian and Albanian), but results of cluster analysis demonstrated the smallest distance between the Balkan donkey and Albanian donkeys..., Balkanski magarac (Equus asinus L.) predstavlja ugroženu, neselektovanu, nestrukturiranu i tradicionalno gajenu autohtonu rasu magaraca. Za formiranje standarda rase i implementaciju odgajivačkih, reproduktivnih i mera upravljanja koje bi omogućile očuvanje i održivu eksploataciju balkanskog magarca, neophodan je uvid u fenotipske karakteristike, genetski status i poreklo balkanskog magarca. Stoga, jedan od ciljeva istraživanja je uspostavljanje morfometrijskih, biohemijskih i hematoloških vrednosti za ispitivanu populaciju balkanskog magarca sa teritorije Srbije, kao i utvrđivanje uticaja starosti na ispitivane parametre. Među rasna sličnost morfometrijskih parametara je analizirana upoređivanjem dobijenih podataka za balkanskog magarca sa dostupnim vrednostima morfometrijskih parametara prethodno opisanih rasa magaraca. Takođe, izvršena je procena trenutnog genetičkog diverziteta i strukture tri najvec e populacije magaraca u centralnom Balkanu na osnovu varijabilnosti nuklearnih mikrosatelita (77 jedinki) i mitohondrijskog (mtDNK) kontrolnog regiona (49 jedinki). Dobijeni podaci za kontrolni region (HVR1) mtDNK su poređeni sa 209 objavljenih sekvenci mtDNK drevnih i današnjih magaraca poreklom iz 19 evropskih i afričkih populacija da bi se obezbedio uvid u poreklo i istoriju balkanskog magarca. Ispitivana populacija se sastojala od 77 magaraca, koji su podeljeni u dve starosne grupe (A ≤ 3 godine; B > 3 godine). Ukupno, analizirano je 18 morfometrijskih, 13 hematoloških i 14 biohemijskih parametara. Između grupe A i B, uočena je značajna razlika (P lt 0.05) kod mera za dužinu tela, dužinu glave, obim grudnog koša i telesne mase...", publisher = "Univerzitet u Beogradu, Fakultet veterinarske medicine", title = "Phenotypic and molecular genetic characterization of Balkan donkey population in Serbia, Fenotipska i molekularno-genetička karakterizacija populacije balkanskog magarca u Republici Srbiji", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_8781" }
Stanišić, L.. (2017). Phenotypic and molecular genetic characterization of Balkan donkey population in Serbia. Univerzitet u Beogradu, Fakultet veterinarske medicine.. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_8781
Stanišić L. Phenotypic and molecular genetic characterization of Balkan donkey population in Serbia. 2017;. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_8781 .
Stanišić, Ljubodrag, "Phenotypic and molecular genetic characterization of Balkan donkey population in Serbia" (2017), https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_8781 .